Родился 14 декабря 1952 г. в пос. Артем Бодайбинского района Иркутской области.

В 1976 г. окончил геологический факультет Иркутского госуниверситета по специальности “геологическая съемка и поиски месторождений полезных ископаемых”. В 1974 г., будучи студентом 4-го курса, поступил на работу в лабораторию неотектоники и геоморфологии Института земной коры СО АН СССР. В 1975–1977 гг. – старший лаборант лаборатории неотектоники и геоморфологии, в 1977–1981 гг. – инженер, в 1981–1987 гг. – младший научный сотрудник, с 1987 г. – старший научный сотрудник лаборатории тектонофизики. Защитил кандидатскую диссертацию на тему “Зоны динамического влияния разломов и их структурные особенности (по результатам физического моделирования)”. В 2000 г. ему было присвоено ученое звание старшего научного сотрудника по специальности “геотектоника”.

Научные интересы С.А. Борнякова связаны с исследованием общих закономерностей процессов разломообразования методом физического моделирования. За последнее десятилетие методология его исследований существенно расширилась за счет базовых идей синергетики, мезомеханики, фрактальной геометрии и теории информации. Разрабатывается новая тектонофизическая модель зоны разлома, основанная на принципах мезомеханики и синергетики; проводится комплекс исследований по изучению механизмов формирования Байкальской рифтовой зоны; изучается роль разломов в структуре контроля алмазоносных кимберлитовых тел в Якутской алмазоносной провинции; проводится комплекс исследований, направленных на поиски краткосрочных предвестников землетрясений.

Им выполнены тысячи экспериментов по моделированию процессов формирования зон разломов разного морфолого-генетического типа.

Автор и соавтор более 100 научных работ, в том числе семи монографий, имеет два патента на изобретения, свидетельство на компьютерную программу.

Имеет почетное звание “Ветеран труда” (2002), Благодарность РАН (2009), Благодарность губернатора Иркутской области (2012); награжден Почетной грамотой Президиума РАН и Профсоюза РАН (2002), почетным знаком Сибирского отделения РАН “Серебряная Сигма” (2007), Почетной грамотой мэра г. Иркутска (2007), Почетной грамотой Департамента по недропользованию ЦентрСибНедра (2017).