Родился 21 февраля 1957 г. в г. Сретенске Читинской области.

В 1979 г. окончил с отличием геологический факультет Иркутского госуниверситета по специальности “геологическая съемка и поиски месторождений полезных ископаемых”. С 15.07.1975 по 15.09.1975 был лаборантом лаборатории экспериментальной и теоретической петрологии в ИЗК СО АН СССР. В 1979–1981 гг. – стажер-исследователь, в 1981–1984 гг. – инженер, в 1984–1990 гг. – младший научный сотрудник, в 1990–2000 гг. – старший научный сотрудник лаборатории экспериментальной и теоретической петрологии, в 2000–2016 гг. – заместитель директора института по научной работе, с 2016 г. – заместитель директора по общим вопросам. Защитил кандидатскую диссертацию на тему “Ультрабазит-базитовые ассоциации в докембрии Южного Прибайкалья”.

Ю.В. Меньшагин – специалист в области петрологии ультраосновных и основных пород. При его участии изучена эволюция базит-ультрабазитового магматизма в различных геодинамических обстановках зоны сочленения Сибирской платформы и ее южного складчатого обрамления. Он обнаружил и дал первое описание эклогитов и гранатовых ультрабазитов докембрийской Южно-Муйской глыбы. На Бирюсинской глыбе впервые открыто и детально описано новое проявление щелочных пород и карбонатитов. В Присаянье впервые выделены лампроитоподобные базиты повышенной калиевой щелочности, содержащие обширный спектр барофильных минералов, изучены редкие минералы и показана лампроитовая природа алмазоносных жильных тел Урикско-Ийского грабена, при этом впервые в алмазоносных породах России обнаружены типоморфные минералы лампроитов: прайдерит, баотит, обнаружена новая разновидность щелочных амфиболов – калиевый магнезиоарфведсонит. На основе многомерного статистического анализа предложена новая классификация изоморфных рядов амфиболов. В результате изучения ультраосновных пород Восточного Саяна среди них впервые выделен новый формационный тип – оливинит-верлит-клинопироксенитовый. На основании большого объема выполненных модельных расчетов процессов гранитизации ультраосновных и основных пород показана их роль при формировании коры континентального типа. Выполненные модельные расчеты ультраосновной и основной системы при неравном давлении на фазы показали ведущую роль флюидного давления при эволюции флюидизированных систем. На примере ультраосновных и основных пород различных генетических типов показаны возможности флюидно-петрохимической типизации как одного из возможных методов классификации и описания глубинных пород.

Проведенный комплекс исследований по проблеме нефритоносности складчатых областей позволил разработать критерии их перспективности на этот вид полезных ископаемых, при этом открыт новый нефритоносный район в Восточном Саяне (Ийско-Тагульский гипербазитовый пояс).

В Бельско-Урикском междуречье (Китойская глыба) открыто проявление лазурита, что дало основание выделить новый лазуритоносный район, тем самым существенно расширены перспективы этого обширного региона на камнесамоцветное сырье.

Проводившиеся в течение 20 последних лет работы по изучению алмазоносности Иркутской области привели к открытию в Чуно-Бирюсинском междуречье новых россыпепроявлений алмазов.

С 1987 г. – ученый секретарь диссертационного совета Д 003.022.02.

Автор и соавтор около 300 опубликованных работ.

Является заслуженным ветераном СО РАН (1999), награжден Почетной грамотой РАН и Профсоюза РАН (1999), Почетной грамотой СО РАН (1999, 2004, 2009), юбилейной медалью “В память 350-летия Иркутска” (2012), Почетной грамотой ИНЦ СО РАН (2017), Почетной грамотой мэра г. Иркутска (2017). Имеет почетный знак СО РАН “Серебряная Сигма” (2007).